, including all inherited members.
all_off() | BitArray | [inline, static] |
all_on() | BitArray | [inline, static] |
bit(int index) | BitArray | [inline, static] |
BitArray() (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
BitArray(WordType init_value) (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
BitArray(const BitArray ©) (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
BitArray(const SparseArray &from) (defined in BitArray) | BitArray | |
clear() | BitArray | [inline] |
clear_bit(int index) | BitArray | [inline] |
clear_range(int low_bit, int size) | BitArray | |
compare_to(const BitArray &other) const | BitArray | |
extract(int low_bit, int size) const | BitArray | [inline] |
generate_hash(ChecksumHashGenerator &hashgen) const | BitArray | |
get_bit(int index) const | BitArray | [inline] |
get_class_type() (defined in BitArray) | BitArray | [inline, static] |
get_highest_bits() const | BitArray | [inline] |
get_highest_off_bit() const | BitArray | |
get_highest_on_bit() const | BitArray | |
get_lowest_off_bit() const | BitArray | |
get_lowest_on_bit() const | BitArray | |
get_max_num_bits() | BitArray | [inline, static] |
get_next_higher_different_bit(int low_bit) const | BitArray | |
get_num_bits() const | BitArray | [inline] |
get_num_bits_per_word() | BitArray | [inline, static] |
get_num_off_bits() const | BitArray | |
get_num_on_bits() const | BitArray | |
get_num_words() const | BitArray | [inline] |
get_word(int n) const | BitArray | [inline] |
has_all_of(int low_bit, int size) const | BitArray | |
has_any_of(int low_bit, int size) const | BitArray | |
has_bits_in_common(const BitArray &other) const | BitArray | |
has_max_num_bits() | BitArray | [inline, static] |
init_type() (defined in BitArray) | BitArray | [inline, static] |
invert_in_place() | BitArray | |
is_all_on() const | BitArray | |
is_zero() const | BitArray | |
lower_on(int on_bits) | BitArray | [inline, static] |
MaskType typedef (defined in BitArray) | BitArray | |
num_bits_per_word enum value (defined in BitArray) | BitArray | |
operator!=(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
operator&(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
operator&=(const BitArray &other) (defined in BitArray) | BitArray | |
operator<(const BitArray &other) const | BitArray | [inline] |
operator<<(int shift) const (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
operator<<=(int shift) | BitArray | |
operator=(const BitArray ©) (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
operator==(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
operator>>(int shift) const (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
operator>>=(int shift) | BitArray | |
operator^(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
operator^=(const BitArray &other) (defined in BitArray) | BitArray | |
operator|(const BitArray &other) const (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
operator|=(const BitArray &other) (defined in BitArray) | BitArray | |
operator~() const (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |
output(ostream &out) const | BitArray | |
output_binary(ostream &out, int spaces_every=4) const | BitArray | |
output_hex(ostream &out, int spaces_every=4) const | BitArray | |
range(int low_bit, int size) | BitArray | [inline, static] |
read_datagram(DatagramIterator &scan, BamReader *manager) | BitArray | |
set_bit(int index) | BitArray | [inline] |
set_bit_to(int index, bool value) | BitArray | [inline] |
set_range(int low_bit, int size) | BitArray | |
set_range_to(bool value, int low_bit, int size) | BitArray | [inline] |
set_word(int n, MaskType value) | BitArray | [inline] |
store(WordType value, int low_bit, int size) | BitArray | [inline] |
WordType typedef (defined in BitArray) | BitArray | |
write(ostream &out, int indent_level=0) const | BitArray | |
write_datagram(BamWriter *manager, Datagram &dg) const | BitArray | |
~BitArray() (defined in BitArray) | BitArray | [inline] |